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(Frage) beantwortet  | | Datum: | 14:54 Sa 24.06.2006 | | Autor: | Jette87 |
| Aufgabe | | Aufgabe siehe Anhang |
Hi,
also ich habe mal eine Frage zu dem, wie ich zu den Schnittstellen von pstI komme.
Hier die Daten aus den Verdaus:
E: 4
H: 4
Pst: 0,3 + 3,2
H+E: 1,3 + 2,7
H+P: 0,8 + 1 + 2,2
E+P: 0,3 + 0,5 +3,2
Also EcoRI ist ja oben schon gegeben. Dann den ersten Doppelverdau mit E und H, da kann man ja nichts falsch machen, habe ich dann bei 1,3 eingetragen, rechts, ist ja egal, ob rechtsrum oder linksrum (spiegelsymmetrisch!).
So und dann die Daten eintragen von H+P oder E+P.
Ist es denn so, dass ich von H aus 0,8 in eine Richtung gehe und von dem Punkt an (entweder 0,5 oder 2,1) dann 1 weiter (also 3,5 oder 3,1) und dann die 2,2 weiter bin ich ja wieder bei H oder wie geht das?
Und das muss ich ja nur mit beiden Doppelverdaus (also E+P und H+P) machen und dann schauen, wo 2mal der gleiche Punkt rauskommt oder???
Und wenn ich dann in den Dreifachverdau das eintragen will, dann trage ich doch die Bandengrößen immer von zwischen 2 Schnittstellen ein und nicht von EcoRI ausgesehen jede!? Und wenn 2 Längen gleich sind, dann wären das ja nur 3 Banden und nicht 4 oder wie macht man das?
Vielen Dank im Voraus!
Dateianhänge:
Anhang Nr. 1 (Typ: jpg) [nicht öffentlich]
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| Status: |
(Antwort) fertig  | | Datum: | 23:52 So 25.06.2006 | | Autor: | Wapiya |
HI Jette
> Hier die Daten aus den Verdaus:
>
> E: 4
> H: 4
> Pst: 0,3 + 3,2
Fehler: Da muss ein 0,8 stehen!
> H+E: 1,3 + 2,7
> H+P: 0,8 + 1 + 2,2
> E+P: 0,3 + 0,5 +3,2
Also fangen wir mal an: Man kann das ganze bei diesen Werten noch ganz gut theoretisch lösen. Sonst ist es hilfreich, sich Kreise zu malen und die passend gegen einander zu verschieben.
1) E und H geben einzeln je ein vierer Fragment, schneiden also genau einmal. Zusammen liefern sie ein 1,3 und ein 2,7 Fragment.
2) Pst schneidet zweimal und liefert ein 0,8 und ein 3,2 Fragment.
Das macht zwei Kreise einen mit 0,8 und 3,2 für PST und einen mit 1,3 und 2,7 für Hint und Eco. Die beiden drehen wir jetzt so gegeneinander, dass sie die anderen Doppelverdaus liefern, also Fragmente mit der passenden Länge. Dann können wir das auf einen Kreis übertragen, und die Fragementlänge für den Dreifachverdau ablesen.
Wenn man nicht basteln will, geht das so:
> E: 4
> H: 4
> Pst: 0,8 + 3,2
> H+E: 1,3 + 2,7
> H+P: 0,8 + 1 + 2,2
> E+P: 0,3 + 0,5 +3,2
1) Neu anfangen (nicht bei Eco!) und PST Kreis zeichnen.
2) PST liefert 0,8 und 3,2.
2a) Wenn wir Hint dazu geben, wird das 3,2 zerteilt in ein 1 und 2,2, Hint liegt also auf dem großen Bereich des PST Kreises. Und zwar wo?
2b) Ähnlich für Eco. Für Eco wissen wir aber auch, dass es 1,3 von Hint weg ist.
2c) Und fertig.
Fragen?
Gruß
Wapiya
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